1、賬戶開辦方不同：零余額賬戶一般是指由財(cái)政部門為滿足部門以及單位的需求在銀行開設(shè)的賬戶，而基本存款賬戶則是由單位財(cái)政工作人員自行前往銀行開設(shè)的賬戶；

2、賬戶的用途不同：零余額賬戶主要是用來進(jìn)行財(cái)政支付和財(cái)政清算，而基本存款賬戶可以辦理公司的許多業(yè)務(wù)，包括工資的發(fā)放、日常業(yè)務(wù)的結(jié)算等等；

3、賬戶面向范圍不同：零余額賬戶一般是和政府相關(guān)的單位才能辦理，基本賬戶所有單位都能辦理。

零余額賬戶的管理使用

1、財(cái)政部門：國家的財(cái)政部門主要使用零余額賬戶進(jìn)行相關(guān)項(xiàng)目的財(cái)政支付；

2、預(yù)算單位：預(yù)算單位主要是按照相關(guān)部門的指令，使用零余額賬戶進(jìn)行規(guī)定額度內(nèi)的財(cái)政支付；

3、行政事業(yè)單位：行政事業(yè)單位主要負(fù)責(zé)零余額賬戶預(yù)算單位的賬務(wù)登記工作，如果預(yù)算單位將撥款用在購買物品或服務(wù)上，應(yīng)記為“行政支出”項(xiàng)目。